Свечи на вибрацию, на дизеле ну никак не завязаны, только на запуск в холода. Обгонная муфта может скрипеть, но ДВС не должен из-за ее вибрировать Предлагаю проверить подушки двигателя (состояние, закручены нормально?), шкив коленвала имеет резиновый демпфер - проверить трещины, отслоение резины... Под подозрение может попасть сцепление из-за двухмассового маховика... но я не уверен, могу ошибаться. Видео запуска не помешало бы посмотреть
Свечи под подозрение попали так как именно в момент завода вибрация и в последние дни иногда загорался датчик "пружина". По демферу нужно посмотреть. Подушки конечно тоже проверю